MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL01

Total Repeats: 9089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011758	GAT	2	6	377149	377154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_011758	GCC	2	6	377195	377200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_011758	CGG	2	6	377202	377207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_011758	GAT	2	6	377239	377244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_011758	GCC	2	6	377255	377260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9006	NC_011758	CGA	2	6	377269	377274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_011758	CAGC	2	8	377285	377292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9008	NC_011758	TGC	2	6	377329	377334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_011758	GC	3	6	377396	377401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9010	NC_011758	GGC	2	6	377416	377421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_011758	GCG	2	6	377499	377504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_011758	CCG	2	6	377509	377514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9013	NC_011758	CG	3	6	377544	377549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9014	NC_011758	CGG	2	6	377651	377656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_011758	GC	3	6	377737	377742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9016	NC_011758	GTCG	2	8	377804	377811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9017	NC_011758	CCG	2	6	377812	377817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9018	NC_011758	CG	3	6	377823	377828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9019	NC_011758	GCAGCG	2	12	377845	377856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_011758	TGA	2	6	377905	377910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_011758	GTC	2	6	377916	377921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_011758	CCCG	2	8	377924	377931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9023	NC_011758	ATCA	2	8	377942	377949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9024	NC_011758	CG	4	8	377967	377974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9025	NC_011758	CGG	2	6	378034	378039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_011758	GCGA	2	8	378075	378082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9027	NC_011758	CAGG	2	8	378095	378102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9028	NC_011758	AGG	2	6	378138	378143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_011758	GCCGT	2	10	378208	378217	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9030	NC_011758	CAT	2	6	378229	378234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_011758	C	6	6	378311	378316	0 %	0 %	0 %	100 %	218533560
9032	NC_011758	GCA	2	6	378353	378358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533560
9033	NC_011758	GC	3	6	378360	378365	0 %	0 %	50 %	50 %	218533560
9034	NC_011758	CGTG	2	8	378372	378379	0 %	25 %	50 %	25 %	218533560
9035	NC_011758	CAC	2	6	378384	378389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218533560
9036	NC_011758	GGC	2	6	378420	378425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533560
9037	NC_011758	CG	3	6	378435	378440	0 %	0 %	50 %	50 %	218533560
9038	NC_011758	CGGCT	2	10	378476	378485	0 %	20 %	40 %	40 %	218533560
9039	NC_011758	GTC	3	9	378510	378518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533560
9040	NC_011758	CGC	2	6	378531	378536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533560
9041	NC_011758	CGT	2	6	378542	378547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533560
9042	NC_011758	GGC	2	6	378560	378565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533560
9043	NC_011758	GGCC	2	8	378613	378620	0 %	0 %	50 %	50 %	218533560
9044	NC_011758	GCG	2	6	378650	378655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533560
9045	NC_011758	GATGG	2	10	378675	378684	20 %	20 %	60 %	0 %	218533560
9046	NC_011758	CGG	2	6	378719	378724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533560
9047	NC_011758	GGC	2	6	378760	378765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533560
9048	NC_011758	ACCC	2	8	378781	378788	25 %	0 %	0 %	75 %	218533560
9049	NC_011758	GCC	2	6	378820	378825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533560
9050	NC_011758	CAGC	2	8	378837	378844	25 %	0 %	25 %	50 %	218533560
9051	NC_011758	GC	3	6	378843	378848	0 %	0 %	50 %	50 %	218533560
9052	NC_011758	CG	3	6	378868	378873	0 %	0 %	50 %	50 %	218533560
9053	NC_011758	GCCGG	2	10	378890	378899	0 %	0 %	60 %	40 %	218533560
9054	NC_011758	TCG	2	6	378907	378912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533560
9055	NC_011758	GC	3	6	378931	378936	0 %	0 %	50 %	50 %	218533560
9056	NC_011758	CGG	2	6	378959	378964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533560
9057	NC_011758	GCC	3	9	378973	378981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533560
9058	NC_011758	CGG	2	6	379018	379023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533560
9059	NC_011758	GGC	2	6	379034	379039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533560
9060	NC_011758	GTC	2	6	379059	379064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218533560
9061	NC_011758	GAC	2	6	379121	379126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533561
9062	NC_011758	GC	3	6	379149	379154	0 %	0 %	50 %	50 %	218533561
9063	NC_011758	CGG	3	9	379213	379221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533561
9064	NC_011758	TCC	2	6	379239	379244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218533561
9065	NC_011758	CGA	2	6	379249	379254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218533561
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9068	NC_011758	CGG	2	6	379392	379397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533561
9069	NC_011758	GC	3	6	379443	379448	0 %	0 %	50 %	50 %	218533561
9070	NC_011758	TCGC	2	8	379486	379493	0 %	25 %	25 %	50 %	218533561
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9073	NC_011758	GAT	2	6	379668	379673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_011758	AAT	2	6	379746	379751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_011758	GGC	3	9	379753	379761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9076	NC_011758	TC	3	6	379767	379772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9077	NC_011758	GA	3	6	379795	379800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_011758	CGG	2	6	379847	379852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533562
9079	NC_011758	GCG	2	6	379861	379866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533562
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9081	NC_011758	CGG	2	6	379904	379909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218533562
9082	NC_011758	GCC	2	6	379964	379969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533562
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9084	NC_011758	ATG	2	6	380001	380006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218533562
9085	NC_011758	CAC	2	6	380013	380018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218533562
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9087	NC_011758	GAGATC	2	12	380115	380126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218533562
9088	NC_011758	CGC	2	6	380162	380167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218533562
9089	NC_011758	GCCG	2	8	380180	380187	0 %	0 %	50 %	50 %	218533562

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.